第 167 章
微小核糖核酸
微小核糖核酸(MicroRNAs)
如果你覺得植物界與動物界之間以異種激素(xenohormesis)形式進行跨界溝通已經很有趣,那就請繼續留意。21世紀一項革命性的發現挑戰了「分子生物學中心法則」:微小核糖核酸,簡稱微小RNA。
讓我帶你回到生物課堂。你或許還記得,我們的遺傳密碼儲存在DNA中,那是我們身體的建造與修復藍圖。但如果藍圖無法傳達給建築工人去實施,那就毫無意義。傳遞這訊息的是RNA。信使RNA會轉錄DNA中的一段序列(基因),並將其翻譯成最終產物,如結構蛋白或酵素。中心法則描述了這個資訊流:基因→信使RNA→蛋白質。但在人類基因組計劃中,卻發現了令人震驚的事實。
只有約2%的DNA實際編碼蛋白質,那剩下98%的DNA是做什麼用的?當我讀書時,超過十億個看似無功能的基因序列被視為「雜訊」、「廢棄序列」或「垃圾DNA」——被認為是我們進化過程中累積的遺傳垃圾。但這樣想恐怕有點浪費。天體物理學中有個類比:暗物質——我們無法解釋宇宙中約85%的物質。基因組的暗物質之謎在2001年被解開:大部分DNA違反中心法則,積極轉錄成非編碼RNA,即不編碼蛋白質的RNA。但它們到底有什麼功能呢?
如今我們知道有超過100種非編碼RNA,但現在我們要聚焦真正重要的:微小RNA。編碼一個平均的信使RNA需要數千個DNA字母序列,相較之下,微小RNA只有約20個字母長。例如,首個被發現的微小RNA長22個字母,取自四字母RNA字母表:UUCCCUGAGACCUCAAGUGUGA。微小RNA的功能是什麼?通常它們會結合信使RNA,阻止其被翻譯成蛋白質。
如果DNA是藍圖,信使RNA是將指令轉化為房屋零件的建築工人,那麼微小RNA就像是監工,阻止某些工人執行工作。這是好事,因為沒有監管,最基本的安全標準都會被忽略。各個元素必須按正確順序建造——基礎尚未澆築時,不能叫屋頂工人上場。
理解微小RNA的調控機制尤其重要,因為一個微小RNA可以阻斷超過1000種不同的信使RNA,換句話說,一個微小RNA能沉默超過1000個基因。用建房比喻:一條簡單指令就能讓一樓所有工人等候,直到地面工人完成。此外,還有調控調控者的調控者——其他非編碼RNA會阻止微小RNA抑制信使RNA,但這就太複雜了。
當複雜度幾乎難以承受時,研究人員發現,雖然RNA字母表有4個字母,20個字母長的微小RNA組合可達一兆種,但人體內活躍的微小RNA只有數千種。在每個細胞中,最常見的五種微小RNA平均佔整個微小RNA池的一半。但2007年,情況變得更有趣。
發現微小RNA至少存在於十二種不同的體液中。(當我讀到這裡,不禁想:等等,我真的知道有十二種體液嗎?)之前認為這不可能,因為細胞外有酵素會分解任何RNA(作為防範病毒的措施,病毒常攜帶RNA)。後來發現微小RNA是被包裹在外泌體中——細胞芽生出的小囊泡。過去這些囊泡被認為是細胞的廢物處理容器。(為什麼科學家不懂時總是先想到廢物?)但2007年發現這些囊泡充滿微小RNA。我們的細胞彼此溝通!例如,肝細胞可釋放微小RNA調控肺細胞基因,肺細胞又可調控腦細胞,反之亦然。它們甚至能透過將微小RNA載貨放入精子或卵子,與下一代對話。
結論是,我們現在可以確定微小RNA可能調控幾乎所有生物過程,並在健康的各個層面扮演決定性角色。無法形成微小RNA的基因改造小鼠甚至無法存活至胚胎階段。各種疾病都與微小RNA調控失常有關。但好消息是,我們可以有所作為。微小RNA的表達可透過飲食改變。
微小RNA與老化
這與老化有何關係?由於微小RNA是所有細胞訊號通路的重要調控者,它們在老化中扮演角色並不令人意外,但這個關聯有特殊意義。首個被發現的微小RNA是在簡單的線蟲C. elegans中。你猜它在那裡做什麼?它調控壽命。降低這個微小RNA的活性會縮短壽命並加速組織老化,而過度表達則顯著延長線蟲壽命。研究發現,該微小RNA的目標是一個DAF-16抑制基因。線蟲的DAF-16基因相當於FOXO基因,後者能使某些原始動物不朽,在人類中則是極端長壽的重要遺傳決定因子之一。微小RNA透過阻斷該長壽基因的抑制,帶來壽命延長。如果你知道C. elegans中少數微小RNA的表達模式,就能預測個別線蟲的壽命。
為了研究微小RNA對哺乳動物壽命的影響,科學家在小鼠身上進行了一系列干預實驗。一組餵食高脂飲食,壽命為101週;第二組餵高脂飲食並可自願運動,壽命114週;第三組餵低脂飲食,壽命127週;第四組低脂飲食加運動,壽命131週;第五組熱量限制高脂飲食,壽命137週;最後一組熱量限制低脂飲食,壽命153週——比高脂飲食組長超過50%。透過此策略,研究人員發現92種微小RNA與壽命相關,其中84種呈反向關係。換句話說,微小RNA通常抑制長壽基因,因此壽命最長組的某些微小RNA水準低了多達90%。但也有例外。

